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En este mismo año vio la luz Windows 2000, una nueva versión de Windows NT muy útil para los administradores de sistemas y con una gran cantidad de servicios de red y lo más importante: admitía dispositivos Plug&Play que venían siendo un problema con Windows NT.
La familia de Windows 2000 estaba formada por varias versiones del sistema: una para las estaciones de trabajo (Windows 2000 Professional) y varias para servidores (Windows 2000 Server, Advanced Server, Datacenter Server).
Windows 2000 incorporaba importantes innovaciones tecnológicas para entornos Microsoft, tanto en nuevos servicios como en la mejora de los existentes. Algunas de las características que posee son:
Almacenamiento:
* Soporte para FAT16, FAT32 y NTFS.
* Cifrado de ficheros (EFS).
* Servicio de indexación.
* Sistema de archivos distribuido (DFS).
* Nuevo sistema de backup (ASR).
* Sistema de tolerancia a fallos (RAID) con discos dinámicos (software).
Comunicaciones:
* Servicios de acceso remoto (RAS, VPN, RADIUS y Enrutamiento).
* Nueva versión de IIS con soporte para HTTP/1.1.
* Active Directory.
* Balanceo de carga (clustering)
* Servicios de instalación desatendida por red (RIS).
* Servicios nativos de Terminal Server.
Estos avances marcan un antes y un después en la historia de Microsoft.